根据商标法规定，在签订许可合同后的三个月内应当到商标局进行备案，但是商标使用许可合同如不经商标局进行备案，根据最高人民法院《关于审理商标民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》的规定，商标许可合同未经备案的，不影响该许可合同的效力，但不得对抗善意第三人。

合同许可方式分为三种：独占许可，排他许可和普通许可。

独占许可是指甲方（许可人）将该商标只许可给乙方（被许可人）独自使用，甲方约定不得使用该注册商标。

排他许可是指甲方（许可人）将该商标许可给乙方（被许可人）使用，甲方约定可以使用该商标但不可另行再许可他人使用该商标。

普通许可是指甲方（许可人）将该商标许可给乙方（被许可人）使用，甲方约定可以使用该商标，也可以许可他人使用其注册商标。

什么叫做不得对抗善意第三人，举例说明：

比如：甲方为商标专有人，甲乙双方签订了许可合同，但不久，甲方与丙方（丙方在毫不知情甲乙双方许可合同的情况下）签署了商标转让合同，并且该转让合同已在商标局进行了登记并核准，此时，对于善意的丙方，乙方不能以其在先商标许可权利进行对抗，只能追究甲方的违约责任。

比如：甲方为商标专有人，甲乙双方签订了许可合同，并没有备案，但不久甲方与丙方（丙方在毫不知情甲乙双方许可合同的情况下）签署了商标排他许可合同并进行了备案，那么丙方将享有该商标的排他许可合同效力，而乙方不得对抗丙方的权力，只能追究甲方的违约责任。

所以对于商标许可，被许可人一定要求许可合同需要到商标局进行备案，这也是保障被许可人的一种合法权益。