著作权和商标权之间会存在冲突，是因为审查的机构不同，商标权的审查机构为中国工商行政管理总局商标局，而著作权的审查机构为中国版权保护中心，著作权和商标权的审查的系统数据不统一，两个审查机构并不是共用一个审查系统，审查的流程不同，商标权需要9个多月的实质审查阶段，而著作权并无实质审查阶段，只有形式审查后合格的则可以进行登记，并颁发证书。

所以导致著作权和商标权将会产生一定的冲突。

当冲突发生的时候，著作权和商标权之间是可以相互制约和相互撤销的。

当然在发生冲突时，证据仍然占据主导证明的地位，对于是否能够证明在先使用和在先拥有权利是非常重要的。

因为无论如何知识产权保护的是原创者和真正的权利人的利益。