中国境内唯一的软件登记机构是什么？地方版权部门能否办理登记？

中国境内唯一的软件登记机构是中国版权保护中心。

根据国家版权局的相关规定，国家版权局主管全国软件著作权登记管理工作，认定中国版权保护中心为软件登记机构，负责全国计算机软件著作权登记的具体工作。经国家版权局批准，中国版权保护中心可以在地方设立软件登记办事机构。

地方版权部门一般不直接办理软件著作权登记业务，但部分地方版权部门可作为中国版权保护中心的代办机构，提供软件著作权登记的相关服务。办理计算机软件著作权登记可以咨询小盾知识产权办理。代办经验非常丰富。